Для борьбы с распространившимся в конце XIX в. в России душепагубным сектантством и для ограждения от него Православных созывались специальные Всероссийские миссионерские съезды.
Первый съезд состоялся в Москве в 1887 г. На нем выдвигались предложения применить самые радикальные меры против сектантов - вплоть до того, Чтобы лишать их гражданства. Эти же меры применялись и к «упорствующим раскольникам».На втором миссионерском съезде, состоявшемся в 1891 г. также в Москве, была поставлена задача прежде всего разобраться в сущности учений сектантов, определить, на¬сколько вредны некоторые из них. Раздавался призыв к единству действий»против натиска этих псевдохристианских сект на Православие, а также принять меры административного воздействия против совращения в эти секты Православных. Съезд констатировал: «Быстрый рост этих сект является серьезной опасностью для государства». В постановлении съезда предлагалось: «Всем сектантам должно быть воспрещено покидать свои места жительства. Паспорта сектантов должны быть помечены особым образом, так чтобы их нигде не принимали на работу, ни на жительство, пока жизнь в России не станет для них невыносимой. Дети их должны силою отбираться и воспитываться в православной вере».
Третий миссионерский съезд, проходивший в 1897 г. в Казани, апеллировал к светской власти, чтобы она оказала помощь внутренней миссии изданием законов для ограждения Православия и пресечения активности сект, опасных не только для церкви, но и для государства. «Принадлежность к некоторым исповеданиям, — говорилось в решении съезда, — признать порочащим обстоятельством, которое давало бы обществу право высылать их последователей в Сибирь». Предлагалось ссылать совратившихся без суда, по приговорам сельских сходов.Четвертый миссионерский съезд состоялся 1908 г. в Киеве. Он констатировал активизацию сектантов, особенно баптистов, в Киеве, Харькове, Одессе, в Москве и в СПБ. Сектанты вовлекали в свои секты в основном молодежь - из крестьян, солдат, мастеровых, приходивших на заработки в указанные города, устраивали свои школы, больницы, проводили свои съезды.Пятый миссионерский съезд состоялся в 26 июня-4 августа 1917 г. в Бизюковском монастыре (Херсонская губерния). Съезд констатировал «небывалую пропаганду сектантства». В своих решениях съезд поставил задачу вести борьбу не только с сектантством, но и с «социализмом». Принято также решение о привлечении к миссионерству монастырей, создании специальных миссионерских школ, регулярном созыве миссионерских съездов и о учреждении при Синоде Миссионерского совета. Но этого осуществить уже не удалось.Кроме того, были проведены специальные архиерейские съезды в 1885 и 1897 гг. в Казани, в 1886 г. - в Киеве, в 1910 г. - в Иркутске, обсуждавшие проблемы борьбы с сектантством.